合同印花税应由公司总部审报交纳，可挑选公司总部或子公司所在城市负责人税务机关单位交纳。子公司签署来的合同书合理，子公司归属于分支机构，在法律法规上经济发展上沒有自觉性，只是是源公司总部的附设组织。一般获得工商营业执照的子公司可以单独百签署合同，但是一般合同书方必须总公度司的受权或是是加盖公司总部图章，获得公司总部的追认。

《我国税务质监总局有关集团公司內部应用的相关凭据征缴合同印花税问题的通来知》(国税发[2009]9号)要求,针对集团公司内具备公平法律法规影响力的核心中间自行签订、确立彼此销货关联、据以便一手货源和清算、具备合同书特性的凭据,应按照规定征缴合同印花税。知针对集团公司內部执行计划应用的、不具备合同书性道质的凭据,不征缴合同印花税。依据上述要求,子公司与分公司中间签署的具备合同书特性的凭据,理应按照规定交纳合同印花税。

《公司法》

第十四条

企业可以注册分公司。设立分公司，理应向企业登记机关单位申请办理备案，领到企业营业执照。子公司不具备主体资格，其法律责任由企业担负。 企业可以开设分公司，子公司具备主体资格，依规单独担负法律责任。