伴随着中国开放的持续发展趋势，在我国海港的进出口贸易订单量逐渐扩大，为出口外贸进出口贸易业务流程业务的货物运输代理（下称“货代公司”）领域也迅猛发展起來。做为一个新型行业，货代公司领域不管在成本核算上或是在流转税（在这里指增值税）的计税基础上都和一般的公司不一样，从而给该领域所得税的税收征管产生了一些新的难题。
　　与传统行业对比，货代公司领域本身有一套基本上的项目操作步骤。一般业务流程包含八个流程：合同书确定→海运订舱出号→分配进货→分配出口报关、送检、报检→提货单确定→运输费收付款→审签提货单→退核销单。从服务范围看，该领域可区划为路运、国际空运和国际海运代理商；从货代公司的服务项目行业看，有中国货物运输代理和国际性货物运输代理。文中探讨解析的另一半为国际性海上运输代理商。
　　从对青岛市南区税务局2006年管辖1054户货代公司公司的调研情形看，2006年度企业所得税年度汇算清缴完毕后，赢利562户，亏本492户，应缴企业所得税累计16875106 元。整体看，货代公司领域亏损面较为高。根据对货代公司公司花费指标值的剖析，亏本的缘故多在收益和成本费上。
　　货代公司领域亏本的真實缘故
　　1.有一些公司不按《企业财务制度》的基本准则计算，尤其不是依照“收付实现制标准”计算收益成本。计算上收益落后、成本费提早或虚造。大部分企业是以给出税票具体收付款时做为完成收益。导致收益落后，促使企业所得税应缴税收入额能够 在不一样本年度内调整。
　　2.依照企业所得税法要求，货代公司领域增值税的计税基础是应收款新项目减掉适应新项目的差值，与一般按主营业务收入全额的计税增值税不一样。绝大多数企业遭受该领域增值税差值计税的危害，会计上对主要经营的业务收益也推行收付款差值计算，不按全额的计算主要经营的业务收益，而应用应收款项和适应账款差值倒挤收益，沒有主要经营的业务成本费学科；在所得税申报时仅有毛收入而沒有主要经营的业务成本费。而这二者是有本质的区别的，应用主要经营的业务收益和主要经营的业务成本费学科计算收益成本费，企业所得税规定成本费税前列支务必有真正、合理合法、合理的会计原始凭证；而采用用应收款项和适应账款差值倒挤收益的方法则最少出现两种难题：一是能够 虚似适应账款帐户和额度，适应账款帐户长期性有大批量的账户余额；二是适应账款额度产生时沒有真正、合理合法、合理的会计原始凭证，而运用这种“沒有真正、合理合法、合理的会计原始凭证”所记述的适应账款额度来抵减收益得到的净利润比较严重违反了《企业财务制度》，也不符企业所得税收益成本费的配比原则和成本费工程的真实有效标准。
　　3.成本费税前列支新项目比较严重失帧，存有虚开增值税票（海运费用、陆运费、货运站费、装卸搬运费等）、收条税前列支或根据税票大头小尾方式两列成本费难题，有一些货代公司公司中间乃至虚开增值税票提升主营业务成本。成本费新项目无初始票据，或用影印件、京东白条税前列支成本费，或用本部门的业务流程数据信息即应付款数据信息做适应成本费新项目额度，导致利润率较低。
　　4.提成收益不进账。在货代公司领域中，提成一般有俩种方式。一是船运公司给货代公司公司佣金（或折扣优惠、或流动资产退还、或为货代公司公司费用报销花费）；二是国外代理同业业务交给国内代理同业业务港口实际操作费（无税票，但应做主营业务收入解决）。有一些公司佣金收益不进账。
　　5.搞混增值税与企业所得税扣减新项目期限，使应缴企业所得税落后。因为货代公司领域增值税推行的是收付款差值为计税基础，并且税务行政机关容许按时清算运输费的货代公司公司在未得到税票或合理合法凭据以前在预估增值税时对已产生的物流运输花费按照计划成本费优先扣减，待与托运人清算并获得税票或合理合法凭据后的当月，按真实清算额度调节当月销售额。这一要求与企业所得税抵扣规定有很大差别。大多数货代公司公司沒有区别增值税与企业所得税现行政策的不一样，在企业所得税的测算上采取了增值税的扣减规格。
　　6.许多 货运代理公司授权委托代理记账公司做账，对接不标准，会计与业务流程存有失衡状况。
　　改进措施
　　一、 标准成本核算层面
　　1.完全标准货代公司领域成本核算，严苛依照收益成本费确定标准，以《企业财务制度》标准货运代理公司的财务核算，改正一些货代公司公司目前的根据应收款、适应差值测算收益的成本核算方式 ，将差值计算收益改成在所得税申报上全额的体现收益成本费新项目。