贷款给境外公司扣除贷款利息怎样缴纳所得税？

答：由境内的经营机构代收代缴有关的增值税。

依据《营业税暂行条例》（国务院令第540号）第十一条的规定，中华共和国境外的单位或者个人在境内给予应税服务、转让无形资产或是销售不动产，在境内未配有经营机构的，以地区委托代理人为义务人；在境内并没有代理人的，以购买方或是购方为义务人。因而，境外企业在境内配有经营机构的，应当由境内的经营机构为增值税经营者，申请交纳增值税。

企业要以取得的利息费用全额的做为计税基础，计缴所得税。

依据《我国税务质监总局关于做好的通知》（国税发〔2009〕3号）第三条要求，对非居民企业获得来自我国境内的股利分配、投资收益等权益性投资收益和贷款利息、房租、特许权使用费所得、出售资产所得的以及其它所得的理应交纳的企业所得税，推行源泉扣缴，以按照相关法律法规要求或是合同规定对非居民企业立即承担付款有关账款义务的单位或者个人为义务人。

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