代发工资本身是企业支出，不直接计税，但作为成本在计算企业所得税时可税前扣除。算法为：应纳税所得额 = 收入总额 - 成本费用（含合理工资薪金）- 税金 - 损失 ± 纳税调整。企业为员工代发的合理工资薪金支出准予据实扣除，降低应税所得。最终税额 = 应纳税所得额 × 适用税率（一般25%，小微企业等有优惠）。代发工资越多，扣除额越大，税负可能越低。
