公司代发工资入账分两步：1）发放时，财务根据工资表做会计分录：借记“应付职工薪酬”，贷记“银行存款”（实际支付总额），同时借记“管理费用”等成本科目，贷记“应付职工薪酬”（计提）；2）代扣个税和社保个人部分：借记“应付职工薪酬”，贷记“应交税费—应交个税”和“其他应付款—社保”。银行回单作为原始凭证，确保账实相符。
