公司代发工资时,会计分录主要涉及“应付职工薪酬”与“银行存款”两科目。计提工资时,借记管理费用等相关科目,贷记“应付职工薪酬”。发放工资时,借记“应付职工薪酬”,贷记“银行存款”。若存在代扣项目,如个税、社保,则需先通过“其他应付款”过渡,借记“应付职工薪酬”,贷记“银行存款”及“其他应付款-个税/社保”等。此分录准确反映企业薪资发放情况,确保财务记录清晰合规。