是的，公司代发工资会自动代扣个税。根据税法规定，用人单位在发放工资前，必须依法计算并从员工应发工资中扣除个人所得税（以及社保、公积金个人部分），再将税后金额打入员工账户。扣税采用“累计预扣法”，按3%–45%累进税率执行，并于次月15日前向税务机关申报缴纳。员工收到的是税后实发工资，无需自行缴税（除非有其他收入需年度汇算）。若公司未代扣，属违法行为，将面临税务处罚。
