公司自主代发工资是指企业通过自身银行账户,自行操作将工资发放至员工个人账户,无需委托第三方或人力资源公司。企业需在银行开通代发功能,每月整理员工姓名、身份证号、银行卡号及应发金额等信息,通过企业网银或柜面提交代发文件,银行审核后批量转账。公司须依法履行个税代扣代缴义务,并在自然人电子税务局完成申报。该方式成本低、控制力强,但需具备一定财务处理能力。