代发工资超过5000元需依法缴纳个人所得税。我国个税起征点为每月5000元，超出部分按3%–45%超额累进税率预扣预缴。例如：月工资8000元，减除5000元后应纳税所得额为3000元，适用3%税率，应缴个税90元。用人单位作为扣缴义务人，须在代发工资时自动计算并代扣税款，再将实发工资打入员工账户。银行仅执行转账，不负责扣税。未依法扣缴将面临税务处罚。
