代发工资个税风险主要指企业未依法代扣代缴个税。如虚列人员、拆分工资、用发票抵薪等方式逃税，或申报金额与实际发放不符。一旦被查，将面临补税、罚款、滞纳金及信用受损。企业应确保工资数据真实，通过正规渠道代发并准确申报，防范税务合规风险。
