代发工资协议需加盖企业公章或财务专用章方为有效。企业公章代表公司法人意志,具有法律效应,适用于各类正式文件及协议。财务专用章则专用于企业财务事务,确保资金运作的合法性与规范性。签订代发工资协议时,企业应仔细核对协议内容,确保无误后,在协议上加盖公章或财务专用章,以证明协议的真实性与合法性。双方各执一份,共同遵守协议条款,确保薪资发放顺利进行。