根据《中华人民共和国个人所得税法》规定，无论工资是由单位直接发放还是通过代发方式发放，均需要依法申报并缴纳个人所得税。公司通过银行代发工资时，需按实际工资额缴纳个税，由公司报税时自行申报，银行不会在代发工资时扣税。代发工资只是一种工资发放方式，不会改变工资的性质和税收规定。在代发工资情境下，代发机构或单位作为支付所得的一方，需根据员工的个人所得税申报情况，确定应纳税所得额，并计算应扣缴的个人所得税额，确保扣缴的准确性和及时性。
