周六周日代发工资是合法的，但前提是公司所采用的薪酬支付方式能够在这两天正常运行。若采用银行代发形式，而银行周末休息，则无法实现发放，此时公司应提前在最近的工作日支付工资。代发工资作为一种支付方式，只要确保按时、足额支付，即符合法律规定。《劳动法》规定工资需以货币形式按月支付，不得克扣或无故拖欠。因此，在周末代发工资的合法性主要取决于支付渠道的可操作性及是否符合相关法律法规的要求。
