出纳代发工资是合法的。出纳是公司财务人员，负责资金管理，发放工资属于其职责范围。只要出纳依据公司薪酬制度和考勤记录，通过银行转账或现金方式，按时足额支付工资，并遵守财务和劳动法规，该行为即合法合规。出纳代发是企业常见的正常操作。
