公司代发工资必须依法代扣代缴个人所得税。根据中国税法，企业在发放工资时，需按员工应纳税所得额计算并代扣个税，再将税款上缴税务机关。这是公司的法定义务，并非可选项。即使通过银行代发，也须在申报后完成扣税操作。未按规定代扣代缴，企业将面临罚款、滞纳金等法律责任。因此，代发工资与缴税紧密关联，不能分离。
