个体工商户代发工资要交税，但分两部分： 1. 员工个税：个体户作为扣缴义务人，必须依法代扣代缴员工的个人所得税，并按月申报； 2. 自身经营所得：个体户业主给自己“发工资”不计税，因其收入属于经营所得，按5%–35%税率缴个人所得税（非工资薪金），且业主工资不得税前扣除。 总之，给员工发工资须代扣个税并申报，否则属违法；个体户自身所得则纳入经营所得统一纳税。
