代发工资是否扣税，看应纳税所得额。每月工资先减5000元起征点、五险一金和个人专项附加扣除（如子女教育、房贷等），剩余部分若超过0元即需缴税。例如，扣除后应纳税所得额在0-3000元的，按3%税率扣税。企业作为扣缴义务人，在发放工资时代扣个税，银行不直接扣税。
