是的，总包单位必须代发农民工工资。根据《保障农民工工资支付条例》，工程建设领域推行分包单位委托总包代发制度。虽用“推行”一词，但结合条例上下文，实为强制性要求。总包须通过农民工工资专用账户，直接将工资支付到工人本人银行账户。分包单位负责编制工资表并交总包，建设单位须将人工费足额拨付至专用账户，且总包不得因工程争议拒发工资。未按规定执行将被处罚。
